الببتيد هو سلسلة قصيرة من الأحماض الأمينية، وترتبط الأحماض الأمينية في الببتيد ببعضها البعض في تسلسل بواسطة روابط تسمى روابط الببتيد، وعادةً ما يتم تمييز الببتيدات عن البروتينات بطولها الأقصر، وعلى الرغم من أن العدد المقطوع من الأحماض الأمينية لتحديد الببتيد والبروتين يمكن أن يكون عشوائيًا.
ما هي الببتيدات الفردية
يمتد خارج الببتيد موجود في الطرف الأميني لبروتين ناشئ، ويعمل عن طريق دفع آلية النقل داخل الخلية لإحضارها إلى وجهتها المحددة داخل الخلية، أي الشبكة الإندوبلازمية في المسار الإفرازي ببتيد الإشارة (الببتيد الفردي)، وتتكون عادة من سلسلة من حوالي 20 حمض أميني، وهي ضرورية لأنها توجه البروتين إلى حيث يجب أن يذهب.
وإذا كان البروتين للإفراز (النقل خارج الخلية)، فإن ببتيد فردي ضروري لتوجيه البروتين إلى الشبكة الإندوبلازمية حيث ستنمو أكثر وتنضج لتكون جاهزة للإفراز، ويتم التعرف على الببتيد الفردي بواسطة جسيم التعرف على الإشارة (SRP) ويتم قطعه بواسطة ببتيد الإشارة بعد النقل في الشبكة الإندوبلازمية.
تعتبر الببتيدات بشكل عام سلاسل قصيرة من اثنين أو أكثر من الأحماض الأمينية، وفي الوقت نفسه فإن البروتينات عبارة عن جزيئات طويلة تتكون من وحدات فرعية متعددة من الببتيد، وتُعرف أيضًا باسم عديد الببتيدات، ويمكن هضم البروتينات بواسطة الإنزيمات (بروتينات أخرى) إلى شظايا ببتيد قصيرة، وبين الخلايا، ويمكن أن تؤدي الببتيدات وظائف بيولوجية، على سبيل المثال، تعمل بعض الببتيدات كهرمونات، وهي جزيئات تؤثر على مناطق أخرى من الجسم عند إطلاقها من الخلايا.
وظيفة الببتيدات الفردية
تلعب تسلسل الببتيدات المفردة دورًا رئيسيًا خلال الخطوات الأولى للنقل داخل الخلايا لمستقبلات البروتين G(GPCRs)، ويشاركون في استهداف السلاسل الوليدة لغشاء الشبكة الإندوبلازمية (ER) والبدء في دمج المستقبلات المركبة حديثًا في هذه الحيز، وتُعرف فئتان من تسلسلات الإشارات: ببتيدات إشارة الطرفية N، والتي عادةً ما يتم قطعها بعد إدخال ER وتسلسل الإشارات الداخلية، وما يسمى بتسلسلات مرساة الإشارة، والتي تشكل جزءًا من البروتينات الناضجة، ويحتوي حوالي 5-10 ٪ من GPCRs على ببتيدات إشارة N-terminal؛ والغالبية العظمى تمتلك تسلسلات مرساة للإشارة.
وتمت معالجة السبب الذي يجعل مجموعة فرعية فقط من GPCRs تتطلب ببتيدات إشارة لاستهداف/إدخال ER في العقد الماضي من خلال عدد محدود من الدراسات التي تشير إلى أن وجود ببتيدات الإشارة يسهل انتقال ذيل N في غشاء ER، ومن المثير للاهتمام أن العمل الأخير أظهر أن ببتيدات الإشارة لـ GPCRs لا تخدم فقط الوظائف “الكلاسيكية” في المسار الإفرازي المبكر، وقد تنظم ببتيدات الإشارة الزائفة غير المشقوقة كثافة المستقبلات في غشاء البلازما وثنائية المستقبلات، وانتقائية اقتران البروتين G، ومن ناحية أخرى، حتى الببتيدات المشقوقة والمفرزة قد يكون لها وظائف ما بعد ER.
