رابطة لولب-ألفا مكونة من حلزوني ألفا مقسمين بواسطة سلسلة قصيرة من الأحماض الأمينية، مما يؤدي إلى “الانعطاف”.
مفهوم لولب ألفا
- تعتبر (α-helices وsheet) والملفات العشوائية هي العناصر الأكثر شيوعًا للبنية الثانوية في البروتينات.
- تتشكل حلزونات α وتحافظ عليها من خلال تفاعلات العمود الفقري الموازية للمحور الأساسي للحلزون.
- هذه التفاعلات عبارة عن روابط هيدروجينية بين الأكسجين الكربوني والنيتروجين الأميني للحموض الأمينية.
- يتم توجيه السلاسل الجانبية لجميع المخلفات في الحلزون α للخارج وبعيدًا عن المحور الحلزوني، ويمكن أن يؤدي حدوث سلاسل جانبية قطبية أو مشحونة في اللولب إلى تسهيل تفاعلات إضافية مع السلاسل الجانبية الأخرى في الحلزون أو مع عناصر أخرى خارج البنية الحلزونية، مما يضفي مزيدًا من الاستقرار.
أنواع أشكال لولب ألفا
- يمكن تقسيم محاكيات (α-Helix) إلى ثلاث فئات.
- النوع الأول عبارة عن أوليغومرات قصيرة تسعى جاهدة لتكرار التضاريس المحلية لعنصر حلزوني ألفا موجود في واجهة البروتين، وتشمل هذه جسر ثنائي كبريتيد (Cys-Cys -α-helix)، جسر (Glu-Lys lactam α-helix)، حلزون ألفا بتدبيس الهيدروكربونات، رابطة هيدروجينيةبديل (α-helix) وبدائل جسر الملح.
- النوع الثاني عبارة عن جزيئات صغيرة غير ببتيدية ترتبط بمستقبلات الببتيد ولكنها لا تحاكي بالضرورة بنية (α-helix) الأصلية وتعمل ببساطة كمقلدات وظيفية، وثبت أن تحديد المثبطات في هذه الفئة باستخدام عمليات اكتشاف الأدوية التقليدية أمر صعب، ويرجع ذلك أساسًا إلى الفراغ الكيميائي المختلف الذي تشغله جزيئات الأدوية التقليدية.
- يتطابق النوع الثالث (المحاكاة البروتينية) مع تضاريس اللولب الأصلي من خلال محاكاة الاتجاه المكاني لبقايا التعرف على المفاتيح، بدلاً من إعادة تلخيص التشكل الحلزوني الذي لوحظ في محاكاة النوع الأول، ونظرًا لأن شبكة الرابطة الهيدروجينية داخل الحلزون α تعمل على تثبيت التشكل وتوجيه السلاسل الجانبية للأحماض الأمينية على طول السطح المعرض للمذيب.
حيث إن الهدف هو تبسيط هذا الدواء إلى كائن على شكل قضيب يقدم سلاسل جانبية في اتجاه مكاني مماثل لتلك الموجودة في حلزون ألفا الأصلي.
