لقد زرعت الذرة الشامية منذ آلاف السنين، حيث وجدت حبوب وأجزاء من كيزانها في بعض الكهوف في المكسيك يرجع تاريخها إلى حوالي خمسة آلاف سنة قبل الميلاد، عموماً يرى كثير من الباحثين أن أمريكا الوسطى والمكسيك هما الموطن الأصلي للذرة الشامية، إذ وجد أن الجنسين القريبين للذرة الشامية واللذين يمكن تهجينهما معاً، هما جنس الذرة الريانة (Euchlaena) وجنس حشيشة جاما (tripsacum)، موجودان بهذه المناطقة ويعتقد البعض أن المركز الثانوي لموطن الذرة الشامية هو أمريكا الجنوبية في البيرو وبوليفيا والإكوادور حيث توجد أنماط مختلفة منهما في هذه المناطق.
