يستقبل قسم الأحياء الدقيقة السريري الذي يعد أهم أقسام المختبر العديد من العينات المرضية، وتختلف هذه العينات في اختلاف المرض ومسبب المرض من الكائنات الحية الدقيقة وأيضاً تختلف هذه العينات بطرق جمعها ونقلها وتخزين، بحيث تتوزع هذه العينات على الأقسام الداخلية في قسم الأحياء الدقيقة السريري حسب نوع العينة والعامل الميكروبي الممرض.
أنواع العينات في قسم الميكروبيولوجي وطرق نقلها:
1- عينة الدم (Blood sample):
- يتم الكشف من خلال عينة الدم على الكائنات الحية الدقيقة التي أدت إلى تسمم الدم، ويجب إن تسحب عينة الدم للزراعة إذا ظهرت على المريض العلامات سريرية ومنها عدم انتظام في نبضات القلب، ارتفاع درجة حرارة الجسم، اختلال في عدد خلايا الدم البيضاء عن معدلها الطبيعي، وجود قشعريرة، وجود الالتهاب رئوي أو التهاب السحايا، وألم في المفاصل والعضلات، جميع هذه العلامات السريرية تؤكد على زراعة الدم للمريض لمعرفة إذا كان يعاني من تسمم بالدم أم لا.
- يتم سحب الدم لإجراء زراعة الدم باستخدام زجاجة خاصة معقمة ومغلقة، وذلك لتجنب تلوثها في أي مصدر من الكائنات الحية الدقيقة.
- تتمثل عملية السحب لزراعة الدم بعدم المس حيث يتم ارتداء القفازات والكمامات وتعقيم اليد باستخدام كحول بتركيز 70%، وتعقيم زجاجة سحب الدم باستخدام كحول بتركيز 70% ويجب انتظار دقيقة بعد تعقيم الزجاجة، تعقيم ذراع المريض باستخدام كحول 70% ويجب الانتظار بعد ذلك بدقيقة لتفحص موقع وغز الإبرة بعد تعقيم اليد حيث يتم استخدام الأصبع لتفحص موقع وغز الإبرة، بعد تفحص موقع يتم تعقيم ذراع المريض باستخدام اليود ويترك حتى يجف، كما يجب عدم تفحص موقع وغز الإبرة بعد التعقيم باليود، بعد أن يجف اليود يتم سحب الدم في الأنبوبة الزجاجية مباشرة دون لمس ذراع المريض حيث يتم سحب الدم من البالغين بنسبة تقدر من 5 إلى 10 مل إما الرضع يتم سحب ما يقدر من 1 إلى 2 مل، وبعد الانتهاء من السحب يتم إزالة اليود الجافة باستخدام كحول 70% لتجنب حدوث حساسة على ذراع المريض.
- يتم إيصال العينة إلى قسم الميكروبيولوجي بشكل معقم، ويتم التعامل معها داخل القسم حسب حالة المريض الصحية.
- يجب تأكد من عدم تناول المريض لأي نوع من المضادات الحيوية قبل جمع العينة.
2- عينة البول (Urine sample):
- يفضل جمع عينة البول في الصباح الباكر، وذلك لأن الكائنات الحية الدقيقة تكون في تركيز أكبر بسبب تكاثرها في المثانة طوال الليل.
- إذا لم يتمكن من جمع العينة في الصباح الباكر، يجوز جمعها في منتصف النهار ولكن يجب أن تمضي 3 ساعات على الأقل عن التبول الأخير.
- يجب التخلص من الجزء الأول من البول، وجمع الجزء المتوسط منه في أنبوب معقم ويفضل أن تتراوح كمية العينة من 2 إلى 7 مل.
- يجب إيصال العينة إلى المختبر في غضون ساعة واحدة بعد جمعها، وفي حالة التأخير يجب تخزينها في درجة حرارة 4 درجة مئوية ومدة لا تزيد عن 24 ساعة.
3- الخزعات (Biopsy material):
- مثال على العينات الخزعية في قسم الميكروبيولوجي مثل عينات الجلد، خزعة من العضلات، خزعة من الكلى أو الكبد، خزعات من الانسجة أو الدماغ.
- يتم الحصول على مثل هذه العينات من قبل الطاقم الطبي، وتجرى عملية الحصول على هذه العينات في بيئة معقمة في الكامل.
- يتم وضع العينات بعد استئصالها من المريض في مادة تسمى الفورمالين (Formalin)، حيث تقوم هذه المادة على الحفظ الكامل للعينات إلى مدى طويل.
- قد تكون الأقسام الأخرى بحاجة إلى فحص تلك العينات مثل قسم الأنسجة، في مثل هذه الحالة يجب إيصال العينة في البداية إلى قسم الميكروبيولوجي ثم قسم الأنسجة وذلك لتجنب تلوث العينة.
4- عينة سائل النخاع الشوكي (CSF):
- يتم سحب العينة من سائل الدماغي النخاعي (Cerebrospinal fluid) وهذه العينة مهمة لتشخيص مرض التهاب السحايا المعدية، وتشخيص التهاب الدماغ.
- يتم الحصول على العينة من قبل طاقم طبي معقم، حيث يتم سحبها بواسطة إبرة كبيرة توضع على حبل النخاع الشوكي بين فقرات (L 3 -L 4) أو بين فقرات (L 4 -L 5)، وتكون تقنية السحب معقمة ويجب على الكادر الطبي ارتداء القفازات والكمامات ووسائل الحماية الطبية الأخرى وذلك لتجنب العدوى، لأن التهاب السحايا من الأمراض المعدية.
- يتم سحب عينة (CSF) ضمن ثلاثة أنابيب مختلفة وذلك بسب اختلاف حاجة الأقسام في المختبر لعينة (CSF).
5- المسحات (swabs-sample):
- هناك العديد من عينات المسحات قد تصل إلى مختبر الأحياء الدقيقة السريري، ومنها مسحة الأذن (Ear swab Sample)، أو مسحة العين (eye swab sample)، أو مسحة الأنف (Nasal Swab sample)، أو مسحة الحلق (Throat Swab)، وتختلف العوامل الميكروبية المسببة للمرض في جميع العينات.
- مسحة الأنف يجب ترطيب المسحة بمحلول ملحي معقم (sterile saline) قبل أخذ العينة، ثم قم بتدوير المسحة فوق الغشاء المخاطي لتجويف الأنف، يتم بعد ذلك وضع المسحة في وسط نقل المسحة وإرسال العينة إلى المختبر على الفور.
- مسحة الحلق يتم أدخل المسحة بعناية في الفم مع الضغط على اللسان، ثم يتم فرك مسحة على كل منطقة من اللوزتين والبلعوم الخلفي، ويجب أخذ عينات من أي منطقة بها إفراز، وأيضاً لا تسمح للمسحة بلمس اللسان أو الشفتين، يتم وضع المسحة في وسط نقل المسحة وإرسالها إلى المختبر على الفور.
- مسحات الأذن يجب أخذ العينة في لطف وعناية، وذلك لتجنب لمس المسحة لطبلة الأذن، ويجب التوقف عن أخذ المضادات الحيوية قبل 3 ساعات على الأقل من أخذ العينة لأنه قد يعمل على تثبيط نمو الكائنات الحية الدقيقة في الوسط الزراعي داخل المختبر، يتم عمل دوران في الأذن باستخدام المسحة بعيداً عن منطقة طبلة الأذن، ويتم وضع العينة في وسط نقل العينة وإرسالها على الفور إلى قسم الميكروبيولوجي.
- مسحة العين قد يحدث للعين التهاب ملتحمة العين بسبب فيروس (adeno – virus) يتم مسح حول منطقة التهاب في لطف وعناية تامة ووضع المسحة في وسط نقلها وإرسال إلى المختبر.
6- عينات فطرية من الشعر والأظافر والجلد:
- يتم إرسال هذه العينات الفطرية إلى قسم الفطريات داخل مختبر الأحياء الدقيقة السريري.
- عينة الشعر الفطرية، يتم الحصول عليها باستخدام ملقط معقم يقوم على إزالة الشعر من بوصيلة ووضعها في وسط نقل لمنع تلوثها.
- عينة الأظافر، يتم الحصول عليها من خلال مقص معقم ووضعها في وسط لنقلها إلى قسم الفطريات من أجل زراعتها.
- عينة الجلد، يتم تعقيم الجلد باستخدام كحول بنسبة 70% لتجنب الحصول على البكتيريا الطبيعية(normal flora) التي توجد على الجلد بشكل طبيعي، يتم مسح حول منطقة حواف التهاب في الجلد ووضع المسحة في وسط لنقلها إلى المختبر.