هناك عدة طرق لقياس نمو الأحياء الدقيقة، يُمكن قياس هذا النمو تبعاً لإزدياد العدد الإجمالي (Population Number) أو تبعاً للكتلة الإجمالية (Population Mass).

يمكن أن يكون سبب الالتهاب الرئوي مجموعة واسعة من البكتيريا والفيروسات والفطريات في الهواء الذي نتنفسه، يمكن أن يكون تحديد سبب الالتهاب الرئوي خطوة مهمة في الحصول على العلاج المناسب.

Shigellosis هو مرض معدٍ تسببه مجموعة من البكتيريا تسمى Shigella، يُعاني معظم المصابين بالشيجلا من الإسهال والحمى وتشنجات المعدة التي تبدأ بعد يوم أو يومين من تعرضهم للبكتيريا، داء الشيجلا يحل عادة خلال 5 إلى 7 أيام، بعض الأشخاص المصابين قد لا تظهر عليهم أية أعراض على الإطلاق، لكن قد يستمرون في نقل بكتيريا الشيجلا إلى الآخرين، يمكن إيقاف انتشار Shigella عن طريق غسل اليدين بشكل متكرر ودقيق بالصابون واتخاذ تدابير النظافة الأخرى.

تصبغ الكائنات الحية الدقيقة لكي تتم رؤيتها بصورة واضحة تحت المجهر. كما أن هناك نوعان من الصبغات بسيطة وتمييزية (Simple And Differential):

يختلف نمو الأحياء الدقيقة عنه في المختبر، ففي الطبيعة هنالك عدة عوامل تُؤثّر على نمو الأحياء الدقيقة من حيث توفر مقومات النمو كالغذاء والهواء وغيره.

شكل الحياة الميكروبية في المحيط لا تزال في مهدها ولكن من خلال الاستعانة بالآلات في جمع سلسلة من العينات من مختلف التوقيتات وأعماق المياه والتحليل الجينومي واسع النطاق.

حركة الكائنات الدقيقة ذات الأنوية البدائية والعضيات الأخرى الخارجية:

ومن أهم التطورات التي ساهمت في تقدم علم الأحياء الدقيقة الأبحاث التي تعلقت بإثبات "النظرية الجرثومية للمرض" (The Germ Theory Of Disease).

الفيروسات أجسام حية تتصف بخصائص بأنها ليس لها تركيب خلوي وذات تركيب كيميائي بسيط عبارة عن بروتين وحمض نووي وأنها صغيرة الحجم جداً من (20-1400 نانوميتر) بحيث يمكنها المرور من المرشحات البكتيرية كما أنها لا ترى بالميكروسكوب الضوئي.

الفطريات كائنات حية دقيقة ذات نواة حقيقية (Eucaryotes)، تتميز بوجود جدار صلب يتكون إما من السليولوز أو الكيتين وهي إما وحيدة الخلية كما هي في الخميرة (yeast).

الفطريات: هي عبارة عن كائنات حية دقيقة ذات نواة حقيقية (Eucaryotes)، تتميز بوجود جدار صلب يتكون إما من السليولوز أو الكيتين.

يُمكن تعريف علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)، بأنه العلم الذي يتناول دراسة الكائنات الحية المجهرية (الميكروبات) من حيث التركيب والوظيفة وعلاقاتها مع الكائنات الحية الأخرى.

البكتيريا المعوية هي إيجابية الجرام، وهي بكتيريا لاهوائية، المكورات المعوية البرازية (Enterococcus faecalis) و E. faecium تسبب مجموعة متنوعة من الالتهابات، بما في ذلك التهاب المسالك البولية والتهاب البروستات والعدوى داخل البطن والتهاب السليلوز وعدوى الجروح وكذلك تجرثم الدم المتزامن.

تسبب الفيروسات النباتية عديد من الأمراض مثل التبقع الحلقي والتفاف الأوراق والموازيك والنكروزس وتسبب خسارة إقتصادية كبيرة لكثير من المحاصيل.

العقدية الرئوية (المكورات الرئوية) هي بكتيريا إيجابية الجرام المسؤولة عن غالبية الالتهاب الرئوي المكتسب من المجتمع، إنه كائن متعاقب في الجهاز التنفسي البشري، مما يعني أنه يستفيد من جسم الإنسان، دون الإضرار به، ومع ذلك قد تكون العدوى بالمكورات الرئوية خطيرة، حيث لا تسبب الالتهاب الرئوي فحسب، ولكن أيضاً التهاب الشعب الهوائية، التهاب الأذن الوسطى، تسمم الدم، والتهاب السحايا.

فيروس الحمى الصفراء (Yellow Fever Virus): هو أحد الفيروسات المصفرة التي تُصيب الإنسان، وينتقل عن طريق لدغ الحشرات المصابة به، ويسبب هذا الفيروس عدوى الجمى الصفراء، وهي حمى مصحوبة بالتهاب الكبد الحاد واليرقان.

فيروس زيكا (Zika virus): هو أحد فيروسات الفلافيفيروس التي تُصيب الإنسان، وينتقل عن طريق لدغ الحشرات المصابة به، ويُسبب هذا الفيروس مرض حمى فيروس زيكا،

الفيروسات الهربسية (Herpesviruses): هي إحدى عائلات الفيروسات كبيرة الحجم، والتي تضم العديد من الأنواع و الأجناس، والتي تصنف من المجموعة الأولى في تصنيف الفيروسات،

إن الفيروسات كائنات لا خلوية صغيرة الحجم، وتمتلك العديد من الأشكال التي تُحدد مظهرها العام، وتتكون من المادة الوراثية ومن القشرة البروتينية أو ما يسمى الكابسيد،

الفيرويدات أو أشباه الفيروسات (Viroids): هي دقائق أو وحدات أصغر حجماً من الفيروسات، تتكون من الحمض النووي الريبي (RNA) أحادي السلسلة، ولا تمتلك غلاف بروتيني، وتسبب الفيرويدات الأمراض في النباتات فقط.

 فيروسات ألفا (Alphaviruses): هي فيروسات من عائلة الفيروسات الطخائية، والتي تضم جنس واحد هو فيروسات الألفا، حيث تضم العديد من الأنواع، وتصنف من المجموعة الرابعة في تصنيف الفيروسات،

طور التكاثر للفيروسات: هو مجموعة من المراحل، والتي تبدأ بعد دخول الفيروس خلية العائل، وحتى خروجه من الخلية، ويتضمن تكاثر الفيروسات النسخ والترجمة والتجميع.

إن جسيم الفيروسات هو عبارة عن مجموعة من الجينات المجمعة داخل غلاف بروتيني يسمى الكابسيد (Capsid)، ولا يتكون هذا الجسيم من خلايا أو عضيات مثل الميتوكندريا أو البلاستيدات

إن فيروس غانجام هو عبارة عن فيروس كروي مغلف، وينتقل عن طريق القراد، ويُصيب الأغنام والماعز، ويسبب لها مرض نيروبي.

إن فيروس دوجبي هو فيروس كروي مغلف، ينتقل عن طريق القراد، ويُصيب الإنسان، ويُسبب حمى نزفية له.

إن فيروسات الينغتشنغ هي عبارة عن فيروسات عشارية الوجوه ذيلية مع غشاء دهني داخلي، وتضم ثلاثة أنواع تُصيب الأثريات.

هي فيروسات دائري الشكل، وغير مغلفة، وتُصيب الحشرات مثل حشرات المن والنمل والنحل والذباب وغيرها، ولهذه الفيروسات أهمية اقتصادية لحماية النباتات من الحشرات. 

إن فيروس تي الليمفاوي البشري 1 هو فيروس راجعي مغلف مستدير الشكل، يُصيب البشر، ويسبب لهم سرطان الغدد الليمفاوية في الخلايا التائية البالغة (ATL)، ويرتبط في العديد من الأمراض الأخرى.

إن فيروسات البيرموتيترا هي فيروسات غير مغلفة دائرية الشكل، وتضم جنساً واحداً ونوعين من الفيروسات، وتُصيب الحشرات مثل قشريات الأجنحة.

إن فيروسات اليو  هي عبارة عن فيروسات غير مغلفة، وتصيب هذه الفيروسات اللافقاريات مثل القشريات.